在建造过程中和建成后的日常使用中，均宜破坏屋顶的防水和排水系统，造成屋顶漏水。要解决种植屋面的漏水问题，植物根阻拦是关键所在。植物根阻拦可以防止植物根穿透防水层而造成防水功能失效；在没有植物根阻拦措施的情况下，屋面所种植物的根系会扎入防水材料，造成防水层破坏，从而导致渗漏。
防止植物根穿透结构层而造成更为严重的结构破坏；在没有植物根阻拦措施的情况下，屋面所种植物的根系会扎入屋面突出物（如电梯井、通风孔等）的结构层、墙而造成结构破坏。避免由于植物根穿透造成防水层破坏甚至结构破坏而带来的连带损失；屋面结构层上进行园林建设，由于排水、蓄水、过滤等功能的需要，屋面种植结构层远比普通自然种植的结构复杂，而防水层一般处于最下面一层。植物根穿透防水层，将会导致结构层大面积渗漏，必须进行及时维修，情况严重，就必须更换防水材料。
美凯士防水建议选用适当的植物根阻拦材料，以及植物根阻拦层与整个种植屋面系统的配合是关键中的关键。用作植物根阻拦层的顶层。在绿色屋顶花园系统中，如屋面防水结构至少是两层，它必是上面一层，兼具植物根阻拦功能。